More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2625 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  100 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  86.08 
 
 		 316 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  46.36 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  46.42 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  49.49 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  45.28 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  47.74 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.44 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  52.2 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  50 
 
 		 344 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  42.62 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  42.28 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  43.99 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  42 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  46.05 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  37.34 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  47.1 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  39.53 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  43.77 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  48.52 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  51.86 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  50 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  42.67 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  42.04 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.3 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.28 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  33.96 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  40.28 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  40.36 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  34.53 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  33.9 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  33.09 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.19 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  28.9 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  31.27 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  31.27 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  31.27 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  31.27 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  32 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.79 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.63 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  34.8 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  34.8 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  32.25 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  32.86 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  32.86 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  30 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  32.5 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  30.11 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.24 
 
 		 644 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  27.82 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  29.02 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  28.47 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  27.03 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  24.42 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  25.71 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  24.64 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  27.78 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  25.52 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  27.78 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  25.77 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  25.43 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  27.46 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  24.69 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  25.53 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  25.6 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  25.7 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  24.29 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.97 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  26.67 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  28.39 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  23.55 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  24.38 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  25.34 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.7 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  22.42 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>