More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3960 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  100 
 
 		 314 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  98.41 
 
 		 314 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  70.7 
 
 		 314 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  45.64 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  42.51 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  50 
 
 		 316 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  51.18 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  45.07 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  42.86 
 
 		 369 aa  208  7e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  47.24 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  34.67 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  40.07 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  44.06 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  45.67 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  35.97 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  43.14 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.1 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  41.78 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  41.44 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  43.77 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  37.2 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  41.12 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  42.21 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  34.95 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  44.17 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  34.88 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.86 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  39.37 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.57 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  33.69 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  30.5 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  45.8 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.33 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.35 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  38.01 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  29.71 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  32.69 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  32.69 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  28.77 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  29.18 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  29.18 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  29.18 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  29.18 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  28.03 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.27 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  28.63 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  28.72 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  28.42 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  29.07 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  33.68 
 
 		 658 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  30.71 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  27.02 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  29.86 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  24.34 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  28.24 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  28.24 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  28.24 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  39.84 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  30.77 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  27.57 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  26.3 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  33.19 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  31.12 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  28.47 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  27.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  24.25 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  31.93 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  26.76 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  25.26 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  27.08 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  30 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  32.74 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  31.72 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  27.37 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.57 
 
 		 655 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  31.45 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  24.57 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  27.55 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  27.8 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  28.07 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  23.97 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  33.83 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  26.28 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  25.09 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>