More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2661 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  100 
 
 
352 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  81.92 
 
 
354 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  76.32 
 
 
354 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  74.58 
 
 
354 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  74.29 
 
 
354 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  76.02 
 
 
354 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  74.29 
 
 
354 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  74.29 
 
 
354 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  76.02 
 
 
354 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  73.16 
 
 
354 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  76.02 
 
 
354 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  73.16 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  53.8 
 
 
333 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  51.15 
 
 
415 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  51.85 
 
 
350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  51.07 
 
 
366 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.96 
 
 
362 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.31 
 
 
356 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  40.07 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  40.86 
 
 
335 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  38.63 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  38.27 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
335 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  38.55 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  40.07 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 
317 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 
317 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  38.27 
 
 
335 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  34.04 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  33.54 
 
 
323 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  40.14 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  37.59 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  37.81 
 
 
345 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  36.82 
 
 
346 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
316 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.77 
 
 
331 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  32.99 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  31.56 
 
 
322 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  31.53 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  33.97 
 
 
319 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 
324 aa  156  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  33.21 
 
 
316 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  33.09 
 
 
316 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  33.57 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.33 
 
 
322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  32.73 
 
 
314 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  32.85 
 
 
369 aa  145  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  29.71 
 
 
314 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  29.07 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  33.58 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  33.21 
 
 
316 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  25.44 
 
 
317 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  30.88 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  31.23 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  30.53 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  31.03 
 
 
318 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  31.03 
 
 
318 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  35.14 
 
 
326 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  26.36 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  29.47 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  24.54 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.82 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.58 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.58 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.58 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  29.47 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.58 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.58 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  29.28 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  29.47 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  29.47 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  25.73 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  23.59 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  25.89 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  25.89 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  27.52 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  26.5 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  26.52 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  24.65 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  26.24 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  23.94 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  23.71 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  26.19 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  26.49 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  24.39 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  30.18 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  24.38 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  24.09 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  25.09 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  27.23 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>