297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  100 
 
 
356 aa  693    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  49.53 
 
 
415 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.93 
 
 
362 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.03 
 
 
366 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  51.86 
 
 
350 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  43.43 
 
 
354 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  42.31 
 
 
352 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  43.08 
 
 
354 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
354 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  43.08 
 
 
354 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  43.08 
 
 
354 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  43.08 
 
 
354 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
354 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 
354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
354 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  42.15 
 
 
354 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  49.28 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  37.31 
 
 
333 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  42.95 
 
 
335 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
335 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  42.63 
 
 
335 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  40.53 
 
 
335 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  44.22 
 
 
317 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  44.9 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  44.9 
 
 
317 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  39.86 
 
 
332 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  42.86 
 
 
335 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  41.67 
 
 
346 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  43.55 
 
 
335 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  45.23 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  36.61 
 
 
333 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  42.29 
 
 
344 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  43.3 
 
 
316 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.77 
 
 
331 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  39.59 
 
 
319 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  35.76 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  40.79 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  39.26 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  30.03 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  34.97 
 
 
316 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  40.57 
 
 
314 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  39.16 
 
 
314 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
312 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
312 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
324 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  44.79 
 
 
326 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  31.29 
 
 
317 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  36.27 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  31.12 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  36.27 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  32.43 
 
 
316 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  35.56 
 
 
316 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  35.4 
 
 
336 aa  142  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  31.58 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.1 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
316 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  32.84 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  32.84 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  25.55 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  25.55 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  25.55 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  25.55 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  24.82 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  25.55 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  23.49 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  23.49 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.24 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  29.73 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.92 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  27.57 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  25.46 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.35 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.35 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  27.97 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.35 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.35 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  29.84 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  28.11 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>