More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33997 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_34802  putative permease  78.2 
 
 
553 aa  909    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  100 
 
 
539 aa  1117    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  47.94 
 
 
544 aa  509  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46242  putative allantoate permease  45.64 
 
 
543 aa  510  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33164  normal  0.606185 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  50.3 
 
 
562 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  46.46 
 
 
537 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04107  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00120)  49.4 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33930  allantoate permease  41.21 
 
 
577 aa  432  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398969  normal  0.94031 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06810  transporter, putative  43.7 
 
 
566 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00850  transporter, putative  42.57 
 
 
538 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.652064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  41.54 
 
 
565 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  41.53 
 
 
599 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02196  conserved hypothetical protein  43.09 
 
 
555 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08595  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17160)  38.25 
 
 
523 aa  356  5.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  29.89 
 
 
524 aa  216  8e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  27.88 
 
 
503 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  28.01 
 
 
494 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08342  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
456 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0576295  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08578  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
243 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000715764  hitchhiker  0.00000000000000344826 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  24.9 
 
 
505 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
489 aa  158  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  24.35 
 
 
493 aa  153  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  25.89 
 
 
489 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  24.58 
 
 
503 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  26.62 
 
 
508 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  28.17 
 
 
523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  22.81 
 
 
496 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  23.51 
 
 
533 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  23.42 
 
 
493 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  23.87 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 
527 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 
496 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  24.84 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  24.02 
 
 
541 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00570  hypothetical protein  24.84 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  23.87 
 
 
508 aa  130  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  21.48 
 
 
519 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  22.98 
 
 
499 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  25.6 
 
 
503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  23.56 
 
 
548 aa  127  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  22.86 
 
 
524 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  23.55 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04560  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61879  Transporter of Nicotinic Acid  25.5 
 
 
523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.110717  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  25.39 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  27.4 
 
 
512 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00210  hypothetical protein  23.43 
 
 
494 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  21.48 
 
 
518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 
491 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  25.4 
 
 
433 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  26.88 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09294  hypothetical protein  23.15 
 
 
449 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00338794  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  25.83 
 
 
499 aa  113  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04826  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09170)  24.12 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  27.65 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  23.35 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
507 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  27.65 
 
 
435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  25.15 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10267  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15730)  22.18 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213096 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02660  hypothetical protein  23.27 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.11556  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  25.15 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  25.15 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  28.23 
 
 
436 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  25.95 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  25.69 
 
 
444 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  26.05 
 
 
459 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  26.79 
 
 
444 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  20.22 
 
 
455 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09456  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03720)  21.37 
 
 
494 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  26.01 
 
 
466 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  25.13 
 
 
439 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.88 
 
 
442 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08814  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09470)  23.43 
 
 
529 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  23.75 
 
 
498 aa  107  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
444 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  26.17 
 
 
432 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  21.42 
 
 
526 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  25.31 
 
 
440 aa  107  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03776  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01840)  23.7 
 
 
532 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  24.5 
 
 
474 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00110  hypothetical protein  23.8 
 
 
537 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
454 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
444 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
454 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  27.75 
 
 
441 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  28.3 
 
 
442 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72069  putative MFS allantoate transporter  21.51 
 
 
520 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  30.65 
 
 
442 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05240  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
523 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  25.9 
 
 
459 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00380  membrane transporter, putative  21.72 
 
 
522 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>