More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33930 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_33930  allantoate permease  100 
 
 
577 aa  1182    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398969  normal  0.94031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46242  putative allantoate permease  51.12 
 
 
543 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33164  normal  0.606185 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  53.06 
 
 
544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  48.26 
 
 
562 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  43.48 
 
 
565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  44.02 
 
 
537 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34802  putative permease  40.84 
 
 
553 aa  439  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  41.21 
 
 
539 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  39.58 
 
 
599 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04107  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00120)  40.87 
 
 
575 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06810  transporter, putative  40.51 
 
 
566 aa  399  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00850  transporter, putative  41.06 
 
 
538 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.652064  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08595  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17160)  39.07 
 
 
523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02196  conserved hypothetical protein  38.91 
 
 
555 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  28.32 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08342  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
456 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0576295  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  27.25 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08578  conserved hypothetical protein  35.97 
 
 
243 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000715764  hitchhiker  0.00000000000000344826 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  25.84 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  25.58 
 
 
473 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
489 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  29.35 
 
 
508 aa  143  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  26.12 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  26.26 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  26.05 
 
 
503 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  26.85 
 
 
523 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  24.57 
 
 
489 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  23.84 
 
 
541 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
533 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  25.4 
 
 
505 aa  127  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  23.56 
 
 
524 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  24.71 
 
 
568 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  25.99 
 
 
455 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
515 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  23.56 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  22.4 
 
 
540 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 
491 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  22.93 
 
 
519 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00029  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.271602 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 
527 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  23.35 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  22.27 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  26.11 
 
 
503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10662  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
426 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34542  allantoate permease  22.82 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  24.45 
 
 
495 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  22.22 
 
 
499 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01185  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
500 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
441 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
441 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01990  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 
534 aa  107  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  21.9 
 
 
503 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 
496 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  24.14 
 
 
512 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  26.06 
 
 
472 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  25.64 
 
 
438 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  28.09 
 
 
439 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  26.9 
 
 
444 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  26.05 
 
 
432 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00570  hypothetical protein  22.01 
 
 
487 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31639  allantoate permease  22.59 
 
 
519 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338334  decreased coverage  0.00000117277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
439 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  26.18 
 
 
444 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
444 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  26.8 
 
 
436 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.68 
 
 
439 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  21.9 
 
 
526 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  26.06 
 
 
499 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  26.8 
 
 
435 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  26.8 
 
 
435 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  26.02 
 
 
466 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  23.08 
 
 
428 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
447 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00550  hypothetical protein  24.19 
 
 
548 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
430 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  23.91 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
444 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  23.09 
 
 
548 aa  97.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01457  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04470)  23.96 
 
 
496 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  25.86 
 
 
440 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  23.29 
 
 
465 aa  97.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  25.79 
 
 
440 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  25.79 
 
 
440 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  24.53 
 
 
435 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  23.34 
 
 
444 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  24.92 
 
 
445 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  24.9 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10267  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15730)  22.3 
 
 
554 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  27.15 
 
 
440 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72069  putative MFS allantoate transporter  23.37 
 
 
520 aa  95.9  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  25.32 
 
 
440 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  25.09 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  24.93 
 
 
440 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09294  hypothetical protein  22.76 
 
 
449 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00338794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
462 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
445 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>