More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46242 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_46242  putative allantoate permease  100 
 
 
543 aa  1115    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33164  normal  0.606185 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  78.68 
 
 
544 aa  894    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  54.7 
 
 
562 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33930  allantoate permease  51.12 
 
 
577 aa  591  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398969  normal  0.94031 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34802  putative permease  47.56 
 
 
553 aa  541  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  49.9 
 
 
537 aa  527  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  45.64 
 
 
539 aa  510  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  46.04 
 
 
599 aa  489  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04107  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00120)  45.93 
 
 
575 aa  485  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06810  transporter, putative  47.09 
 
 
566 aa  488  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00850  transporter, putative  46.5 
 
 
538 aa  477  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.652064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  44.01 
 
 
565 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08595  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17160)  42.42 
 
 
523 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02196  conserved hypothetical protein  43.3 
 
 
555 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  29.15 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  28.84 
 
 
503 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08342  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0576295  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08578  conserved hypothetical protein  35.52 
 
 
243 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000715764  hitchhiker  0.00000000000000344826 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  24.44 
 
 
496 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  25.11 
 
 
494 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  25.63 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  24.79 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  24.75 
 
 
493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  24.21 
 
 
541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  26.57 
 
 
508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  25.28 
 
 
568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
491 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
489 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  24.79 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  23.52 
 
 
503 aa  137  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  24.79 
 
 
508 aa  136  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  24.77 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  23.92 
 
 
510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  24.79 
 
 
503 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  22.88 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  23.26 
 
 
489 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10662  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000601095 
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  24.31 
 
 
523 aa  127  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05240  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
523 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559352  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09294  hypothetical protein  27.19 
 
 
449 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00338794  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 
533 aa  123  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  24.64 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07648  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00840)  23.24 
 
 
513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000132828  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 
518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02800  tartrate transporter, putative  25.1 
 
 
530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
439 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.39 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  24.46 
 
 
503 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  22.04 
 
 
527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  24 
 
 
548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  20 
 
 
503 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  24.23 
 
 
512 aa  114  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  26.36 
 
 
435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05340  hypothetical protein  22.81 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  23.09 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 
465 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
444 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
441 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
441 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
444 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  24.74 
 
 
499 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  27.65 
 
 
436 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00860  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 
501 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01990  conserved hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  29.1 
 
 
437 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
433 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  22.29 
 
 
498 aa  106  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  26.83 
 
 
439 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  27.16 
 
 
439 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  27.9 
 
 
434 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08423  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 
546 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  28.02 
 
 
442 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00210  hypothetical protein  21.71 
 
 
494 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  21.51 
 
 
540 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  27.9 
 
 
434 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05032  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 
449 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  21.88 
 
 
526 aa  104  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01457  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04470)  26.14 
 
 
496 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00550  hypothetical protein  23.32 
 
 
548 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  28.24 
 
 
456 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  28.39 
 
 
446 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01850  MFS transporter, putative  21.52 
 
 
491 aa  103  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06778  phthalate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03750)  22.75 
 
 
478 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966559  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  27.47 
 
 
434 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
503 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  26.97 
 
 
444 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  24.78 
 
 
434 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  24.78 
 
 
434 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  24.78 
 
 
434 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60854  transporter of Nicotinic Acid  22.47 
 
 
507 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  25.99 
 
 
434 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
452 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  22.64 
 
 
433 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00473  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16690)  23.45 
 
 
507 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
435 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  22.57 
 
 
432 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>