More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65827 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_65827  putative allantoate permease  100 
 
 
544 aa  1121    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.429741 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46242  putative allantoate permease  78.68 
 
 
543 aa  905    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33164  normal  0.606185 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04106  conserved hypothetical protein  55.13 
 
 
562 aa  611  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789789  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33930  allantoate permease  53.06 
 
 
577 aa  585  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398969  normal  0.94031 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  50.68 
 
 
537 aa  542  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34802  putative permease  48.05 
 
 
553 aa  542  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0082411 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_33997  allantoate permease  47.42 
 
 
539 aa  512  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04107  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00120)  48.63 
 
 
575 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.160841  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04129  hypothetical protein  48.91 
 
 
599 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451273  normal  0.0581011 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06810  transporter, putative  49.51 
 
 
566 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00850  transporter, putative  49.59 
 
 
538 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.652064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  45.74 
 
 
565 aa  492  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02196  conserved hypothetical protein  43.23 
 
 
555 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08595  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17160)  42.05 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  29.27 
 
 
503 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  30.56 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08342  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
456 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0576295  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08578  conserved hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000715764  hitchhiker  0.00000000000000344826 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  27.57 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
515 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  27.45 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  28.06 
 
 
494 aa  163  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  25.73 
 
 
489 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  25.29 
 
 
505 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  26.43 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  25.28 
 
 
519 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  26.88 
 
 
568 aa  153  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  26.58 
 
 
473 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 
489 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  24.9 
 
 
493 aa  150  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  24.9 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  26.34 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  26.14 
 
 
503 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  26.32 
 
 
541 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
507 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  25.91 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 
495 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  27.29 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  24.13 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  25.95 
 
 
512 aa  134  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  25.51 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10662  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  23.61 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00860  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 
501 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02800  tartrate transporter, putative  26.81 
 
 
530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  24.07 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  27.49 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08996  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  22.61 
 
 
526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  23.39 
 
 
527 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 
496 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  25.45 
 
 
510 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01990  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 
534 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05240  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 
523 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559352  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07648  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00840)  24.58 
 
 
513 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000132828  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01185  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
500 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  26.51 
 
 
499 aa  123  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  24.59 
 
 
498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00550  hypothetical protein  24.65 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05340  hypothetical protein  22.6 
 
 
511 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09294  hypothetical protein  25.96 
 
 
449 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00338794  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  20.45 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08423  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07050  hypothetical protein  23.52 
 
 
518 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.94962  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
503 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60854  transporter of Nicotinic Acid  23.55 
 
 
507 aa  117  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377771  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  25.63 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  26.93 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01850  MFS transporter, putative  22.65 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00029  conserved hypothetical protein  21.33 
 
 
519 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.271602 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04826  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09170)  23.19 
 
 
456 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  27.16 
 
 
439 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  22.17 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08814  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09470)  23.43 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00180  nicotinamide mononucleotide permease, putative  26.32 
 
 
540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  25.23 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.76 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
439 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02401  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 
1010 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.666261  normal  0.0324765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  25.78 
 
 
435 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05032  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 
449 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00210  hypothetical protein  21.99 
 
 
494 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
452 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01470  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
549 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.658251  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31639  allantoate permease  23.29 
 
 
519 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338334  decreased coverage  0.00000117277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  24.67 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  24.92 
 
 
436 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61879  Transporter of Nicotinic Acid  23.11 
 
 
523 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.110717  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  28.72 
 
 
435 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  27.09 
 
 
456 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
433 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10267  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15730)  24.36 
 
 
554 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
444 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06461  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 
533 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03503  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06550)  22.34 
 
 
547 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>