185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30690 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00842  AMP-binding enzyme, putative (JCVI)  41.35 
 
 
1833 aa  1114    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.340979  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30690  predicted protein  100 
 
 
1582 aa  3268    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.781261  normal  0.243077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  21.39 
 
 
602 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  21.51 
 
 
597 aa  138  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  21.51 
 
 
597 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  21.62 
 
 
1656 aa  135  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  22.19 
 
 
2762 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  23.37 
 
 
1474 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 
578 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  22.4 
 
 
596 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  21.5 
 
 
588 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 
701 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  20.85 
 
 
991 aa  119  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  22.09 
 
 
586 aa  119  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  22.06 
 
 
2997 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 
614 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  20.13 
 
 
725 aa  116  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  20.3 
 
 
579 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  23.03 
 
 
611 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  19.97 
 
 
725 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  21.94 
 
 
1753 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  22.82 
 
 
4165 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  22.44 
 
 
706 aa  108  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  20.87 
 
 
2791 aa  106  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  22.02 
 
 
738 aa  105  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  20.78 
 
 
755 aa  105  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  18.77 
 
 
617 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  19.18 
 
 
617 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  21.34 
 
 
609 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  19.18 
 
 
617 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  21.59 
 
 
2250 aa  102  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  21.94 
 
 
1699 aa  100  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  21.72 
 
 
599 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  21.53 
 
 
2721 aa  99.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  22.36 
 
 
551 aa  99.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  21.43 
 
 
4318 aa  99.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  21.75 
 
 
610 aa  98.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  21.89 
 
 
610 aa  98.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  21.75 
 
 
599 aa  98.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  20.31 
 
 
581 aa  97.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  20.03 
 
 
581 aa  96.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  22.16 
 
 
599 aa  95.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  22.16 
 
 
610 aa  96.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  22.16 
 
 
599 aa  95.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  21.54 
 
 
2103 aa  95.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  23.06 
 
 
620 aa  94.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  19.21 
 
 
620 aa  92.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  21.22 
 
 
590 aa  92.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  21.22 
 
 
590 aa  92.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  21.14 
 
 
578 aa  92.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  20.11 
 
 
592 aa  92  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  20 
 
 
6889 aa  90.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  20.44 
 
 
601 aa  89.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  20.44 
 
 
601 aa  89.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  20.44 
 
 
601 aa  89.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  21.06 
 
 
590 aa  89.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  20.52 
 
 
573 aa  89  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  21.81 
 
 
593 aa  86.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  19.48 
 
 
3235 aa  86.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  20.78 
 
 
1323 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  20.77 
 
 
1789 aa  85.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  22.73 
 
 
626 aa  85.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  21.77 
 
 
576 aa  85.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  20.9 
 
 
592 aa  85.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  21.81 
 
 
6403 aa  85.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  17.95 
 
 
3231 aa  85.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  20.32 
 
 
3208 aa  85.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  21.32 
 
 
6274 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  21.32 
 
 
6271 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  21.32 
 
 
6272 aa  85.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.36 
 
 
629 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  19.8 
 
 
4336 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  19.89 
 
 
4317 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  19.26 
 
 
1067 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  20.51 
 
 
608 aa  83.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  19.62 
 
 
4317 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  21.83 
 
 
583 aa  83.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  20.51 
 
 
1291 aa  83.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  20.51 
 
 
1283 aa  83.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  20 
 
 
4268 aa  82.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.03 
 
 
637 aa  82  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  21.08 
 
 
555 aa  82.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.58 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  19.81 
 
 
622 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.21 
 
 
629 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  19.8 
 
 
1776 aa  81.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.21 
 
 
629 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  19.15 
 
 
1779 aa  81.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.21 
 
 
629 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  19.62 
 
 
4317 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  21.09 
 
 
619 aa  80.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  18.65 
 
 
4332 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  19.81 
 
 
605 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  18.83 
 
 
1801 aa  79.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  19.85 
 
 
606 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  20.62 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  19.4 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  19.69 
 
 
1005 aa  78.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  20.11 
 
 
4342 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  22.52 
 
 
607 aa  79  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>