More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_17820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_17820  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1550  hypothetical protein  90.61 
 
 
395 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3005  putative L-carnitine dehydratase/bileacid- inducible protein F  73.08 
 
 
405 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1436  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  73.08 
 
 
401 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2070  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  69.8 
 
 
409 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1834  CAIB/BAIF family CoA transferase  72.24 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1754  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
508 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2702  CAIB/BAIF family protein  70.84 
 
 
544 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2780  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
508 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3055  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
508 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2647  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
502 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1536  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
500 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2263  CAIB/BAIF family CoA transferase  70.84 
 
 
503 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.549063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1541  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  70.89 
 
 
395 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.199128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1112  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  70.3 
 
 
418 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0556868  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2196  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  69.6 
 
 
434 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5468  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  69.29 
 
 
398 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105901  normal  0.979191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2177  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  69.04 
 
 
403 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2159  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  68.53 
 
 
403 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  68.53 
 
 
403 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1584  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  66.22 
 
 
388 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1565  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.95 
 
 
388 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3615  Formyl-CoA transferase  62.86 
 
 
399 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.130892  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  66.2 
 
 
383 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0423169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1666  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.32 
 
 
391 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4814  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  64.61 
 
 
396 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1639  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  64.88 
 
 
386 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1186  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.05 
 
 
391 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.972451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2445  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  63 
 
 
371 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.949012  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4598  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  66.4 
 
 
399 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0660  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  64.15 
 
 
382 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5895  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  64.62 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4973  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  63.46 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5439  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  62.43 
 
 
376 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1839  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  62.87 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.495897  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5285  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.35 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2094  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  61.6 
 
 
376 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0061  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.35 
 
 
401 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.603541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0110  putative caiB/baiF CoA-transferase family protein  51.64 
 
 
400 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.06 
 
 
401 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.944742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0403  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.32 
 
 
401 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.26 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.189716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1607  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.55 
 
 
404 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199838  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0645  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.32 
 
 
401 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0150  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.98 
 
 
406 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4764  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.98 
 
 
406 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.49 
 
 
423 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5508  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.47 
 
 
406 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5353  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.47 
 
 
406 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.45 
 
 
415 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1535  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.85 
 
 
412 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.23 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.8 
 
 
406 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1328  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.07 
 
 
394 aa  332  9e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.87 
 
 
418 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.87 
 
 
418 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.69 
 
 
415 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.59 
 
 
415 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2484  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.58 
 
 
407 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0601081  normal  0.0181338 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5106  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.09 
 
 
407 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.912284  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.78 
 
 
413 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  43.14 
 
 
425 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0119  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.34 
 
 
413 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.22 
 
 
409 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0816  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.05 
 
 
423 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.83 
 
 
407 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  43.1 
 
 
448 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4069  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.2 
 
 
426 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.36 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  43.32 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  41.62 
 
 
418 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0173  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.96 
 
 
433 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4668  CAIB/BAIF family protein  41.45 
 
 
390 aa  309  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0806  L-carnitine dehydratase  43.29 
 
 
423 aa  308  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.262656  normal  0.194155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0548  hypothetical protein  43.75 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.13 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.62 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05820  hypothetical protein  43.75 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.06 
 
 
387 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5877  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.56 
 
 
422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.55 
 
 
450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.91 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0133  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.31 
 
 
428 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2006  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.69 
 
 
407 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1900  CAIB/BAIF family protein  42.75 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894155  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.2 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24920  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.75 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0813  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.61 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.279858  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  39.9 
 
 
413 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0224  CAIB/BAIF family protein  40.64 
 
 
413 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.75 
 
 
393 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0118  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.87 
 
 
406 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000440239  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0207  CAIB/BAIF family protein  40.64 
 
 
413 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.35 
 
 
415 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6156  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.9 
 
 
409 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.1 
 
 
406 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3269  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.63 
 
 
368 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  41.98 
 
 
396 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0114  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.15 
 
 
381 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.112349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.63 
 
 
433 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>