More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1642 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
405 aa  812    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.189716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0110  putative caiB/baiF CoA-transferase family protein  57.92 
 
 
400 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0061  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.14 
 
 
401 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.603541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0403  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.31 
 
 
401 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.64 
 
 
401 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.944742  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5285  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.4 
 
 
405 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0660  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  60.57 
 
 
382 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3615  Formyl-CoA transferase  58.12 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.130892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1550  hypothetical protein  55.98 
 
 
395 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0645  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.39 
 
 
401 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17820  hypothetical protein  56.49 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1584  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.85 
 
 
388 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1565  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.33 
 
 
388 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5439  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  59.5 
 
 
376 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.93 
 
 
383 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0423169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1639  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.07 
 
 
386 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4814  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.54 
 
 
396 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1666  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.96 
 
 
391 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5895  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  59.28 
 
 
379 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2094  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.03 
 
 
376 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3005  putative L-carnitine dehydratase/bileacid- inducible protein F  53.5 
 
 
405 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4973  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.73 
 
 
383 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1186  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.69 
 
 
391 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.972451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1839  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  55.41 
 
 
377 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.495897  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4598  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.29 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2445  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.35 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.949012  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2647  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
502 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1754  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
508 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2780  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
508 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1834  CAIB/BAIF family CoA transferase  54.55 
 
 
479 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1536  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
500 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2263  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
503 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.549063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3055  CAIB/BAIF family CoA transferase  55.3 
 
 
508 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2702  CAIB/BAIF family protein  55.3 
 
 
544 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1541  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  55.47 
 
 
395 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.199128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1436  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.45 
 
 
401 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2070  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.38 
 
 
409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1112  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.2 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0556868  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5468  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.02 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105901  normal  0.979191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2196  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.13 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2177  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.78 
 
 
403 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2159  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.78 
 
 
403 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.78 
 
 
403 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1607  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.06 
 
 
404 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199838  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5508  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.51 
 
 
406 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5353  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.51 
 
 
406 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4764  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.26 
 
 
406 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0150  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.26 
 
 
406 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.98 
 
 
423 aa  358  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2484  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.91 
 
 
407 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0601081  normal  0.0181338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.45 
 
 
418 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.22 
 
 
418 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5106  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.17 
 
 
407 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.912284  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.79 
 
 
415 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0119  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.1 
 
 
413 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.69 
 
 
406 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3269  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.43 
 
 
368 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  43 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  44.58 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  44.1 
 
 
448 aa  329  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.86 
 
 
415 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4069  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.22 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.82 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  41.01 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1310  Alpha-methylacyl-CoA racemase  43.07 
 
 
406 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1386  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.81 
 
 
406 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331191  normal  0.197084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2825  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.57 
 
 
406 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0265401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1408  Formyl-CoA transferase  43.56 
 
 
406 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0926  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.56 
 
 
406 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.73 
 
 
452 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.32 
 
 
406 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1614  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.58 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.57 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0114  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.24 
 
 
381 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.112349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2169  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.24 
 
 
381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0321  CaiB/BaiF family protein  43.47 
 
 
421 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0117662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.72 
 
 
407 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.39 
 
 
393 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.59 
 
 
407 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1463  putative acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  43.97 
 
 
381 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  43.58 
 
 
406 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  44.44 
 
 
544 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  43.22 
 
 
406 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  44.44 
 
 
577 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  43.22 
 
 
406 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  43.22 
 
 
406 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  43.22 
 
 
406 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4232  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.28 
 
 
372 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575705  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  44.44 
 
 
568 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1084  CAIB/BAIF family protein  44.18 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.254633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1045  CAIB/BAIF family protein  44.18 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.89 
 
 
413 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.89 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.32 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5877  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.3 
 
 
422 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.13 
 
 
407 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4411  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.13 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.544796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0796  putative transmembrane protein  42.57 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05820  hypothetical protein  42.19 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7130  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.96 
 
 
434 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>