More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4764 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5508  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  99.01 
 
 
406 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0150  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  90.89 
 
 
406 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4764  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
406 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5353  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  99.01 
 
 
406 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1550  hypothetical protein  49.74 
 
 
395 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5285  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.87 
 
 
405 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3005  putative L-carnitine dehydratase/bileacid- inducible protein F  48.73 
 
 
405 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17820  hypothetical protein  48.98 
 
 
395 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2070  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.62 
 
 
409 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0660  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.59 
 
 
382 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1834  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.63 
 
 
479 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1112  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.76 
 
 
418 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0556868  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1754  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
508 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2263  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
503 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.549063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2647  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
502 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2702  CAIB/BAIF family protein  50.26 
 
 
544 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5439  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.23 
 
 
376 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2780  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
508 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5468  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.25 
 
 
398 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105901  normal  0.979191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1536  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
500 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3055  CAIB/BAIF family CoA transferase  50.26 
 
 
508 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2196  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.38 
 
 
434 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1839  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.62 
 
 
377 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.495897  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1436  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.84 
 
 
401 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1541  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.11 
 
 
395 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.199128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2094  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.1 
 
 
376 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0110  putative caiB/baiF CoA-transferase family protein  45.66 
 
 
400 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4973  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.52 
 
 
383 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2445  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.86 
 
 
371 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.949012  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2159  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.23 
 
 
403 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.23 
 
 
403 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3615  Formyl-CoA transferase  49.34 
 
 
399 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.130892  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2177  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.23 
 
 
403 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1584  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.25 
 
 
388 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5895  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.51 
 
 
379 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1639  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.87 
 
 
386 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0403  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.64 
 
 
401 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1607  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.93 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0061  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.21 
 
 
401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.603541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.1 
 
 
401 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.944742  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1666  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.42 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4814  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.14 
 
 
396 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1565  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.86 
 
 
388 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181246  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1186  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.14 
 
 
391 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.972451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.36 
 
 
423 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.42 
 
 
383 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0423169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.04 
 
 
405 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.189716  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4598  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.81 
 
 
399 aa  338  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0645  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.38 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.1 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0119  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.82 
 
 
413 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391223  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.69 
 
 
413 aa  295  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.35 
 
 
418 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.35 
 
 
418 aa  293  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.73 
 
 
404 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1328  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  44.3 
 
 
394 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  44.39 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.57 
 
 
415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.05 
 
 
415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  43.88 
 
 
396 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0321  CaiB/BaiF family protein  43.77 
 
 
421 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0117662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0816  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.31 
 
 
423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.13 
 
 
406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3203  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.65 
 
 
406 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.16 
 
 
415 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  43.07 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0806  L-carnitine dehydratase  41.41 
 
 
423 aa  285  8e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.262656  normal  0.194155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.8 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.07 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.18 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.35 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0813  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.9 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.279858  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1285  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.35 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0260  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.8 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0224  CAIB/BAIF family protein  40 
 
 
413 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0207  CAIB/BAIF family protein  40 
 
 
413 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.63 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2142  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.45 
 
 
446 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.12 
 
 
405 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  40.83 
 
 
544 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1408  Formyl-CoA transferase  39.65 
 
 
406 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1386  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.65 
 
 
406 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331191  normal  0.197084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.25 
 
 
415 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0926  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.65 
 
 
406 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  40.83 
 
 
577 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  40.83 
 
 
568 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  40.89 
 
 
406 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0743  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.41 
 
 
406 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.492598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  40.89 
 
 
406 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0133  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40 
 
 
428 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  40.89 
 
 
406 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  40.39 
 
 
406 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  40.89 
 
 
406 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0173  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.62 
 
 
433 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1900  CAIB/BAIF family protein  42.12 
 
 
401 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894155  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.9 
 
 
406 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.62 
 
 
430 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  36.21 
 
 
427 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1981  Formyl-CoA transferase  39.22 
 
 
425 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  hitchhiker  0.00178281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>