More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1457 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1457  ABC-type sugar transport system, permease component  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 
310 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  45.16 
 
 
310 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
310 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  44.88 
 
 
310 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  45.16 
 
 
310 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  45.16 
 
 
310 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
308 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  45.16 
 
 
310 aa  278  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 
310 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  45 
 
 
310 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 
310 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
318 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2094  sn-glycerol-3-phosphate transport system, binding protein inner membrane component  39.52 
 
 
293 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236232  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06397  hypothetical protein  37.8 
 
 
293 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.64 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  34.64 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  34.64 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1265  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  33.8 
 
 
293 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0112  putative sugar ABC transporter (permease protein)  34.69 
 
 
293 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.33 
 
 
293 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
285 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.26 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00810  permease component of ABC-type sugar transporter  35.56 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0124807  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
313 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1696  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.16436  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.53764 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
293 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
293 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
294 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
294 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
293 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1695  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0447  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 
294 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
294 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
294 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  0.0342542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3493  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 
294 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
293 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  35 
 
 
293 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
301 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0348  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
294 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
306 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
302 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.644081  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3758  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.18 
 
 
295 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
293 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
293 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
304 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
293 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
293 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
293 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
293 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3747  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.74 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3825  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.74 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3868  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.74 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3927  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.74 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.961515 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03301  glycerol-3-phosphate transporter subunit  33.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03254  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0264  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.332041  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3649  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  33.8 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3871  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.8 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3731  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.45 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
306 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3930  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.45 
 
 
295 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4766  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.45 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  0.380759 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
306 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
352 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
292 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
288 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.967188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
293 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
293 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
293 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
322 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.518821 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
290 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.55 
 
 
305 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
288 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890254  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3961  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.06 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0257  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.06 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0118  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.17 
 
 
295 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
293 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3654  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.06 
 
 
295 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.702231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
306 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>