47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3556 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  54.29 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  53.71 
 
 		 176 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  49.4 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  51.52 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  51.18 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  53.61 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  52.98 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  53.01 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  48.21 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  51.48 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  46.06 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  48.52 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  47.9 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  43.2 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  43.71 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  39.89 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  42.35 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  29.93 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  29.25 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  28.07 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  27.94 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  26.74 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  26 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  28.65 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  32.59 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  30.17 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1793  Phosphoesterase HXTX  29.31 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.185656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  27.12 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  26.28 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  24.82 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 179 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  29.37 
 
 		 215 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  23.44 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.85 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>