35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0662 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  71.27 
 
 		 176 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  61.63 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  58.18 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  54.07 
 
 		 196 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  50.6 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  51.52 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  53.49 
 
 		 182 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  46.39 
 
 		 179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  50.59 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  47.46 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  47.93 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  47.43 
 
 		 191 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  49.69 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  48.26 
 
 		 180 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  49.14 
 
 		 188 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  41.57 
 
 		 197 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  41.07 
 
 		 187 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  45.24 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  31.29 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  24.02 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  22.91 
 
 		 172 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  24.12 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  25.76 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  29.61 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  22.91 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  24.52 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>