46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  59.78 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  54.07 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  59.78 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  51.76 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  51.19 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  50.29 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  49.4 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  50.6 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  54.04 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  52.83 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  50 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  49.4 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  48.21 
 
 		 192 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  47.67 
 
 		 197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  45.81 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  42.41 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  40.51 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  44.24 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  25.17 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  27.62 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  27.62 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  27.62 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.99 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  22.7 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  21.28 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  32.11 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  26.95 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  21.47 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  21.47 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2653  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2904  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2951  2'-5' RNA ligase  32.41 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  28.83 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  24.72 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2630  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 169 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.987674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  29.2 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>