46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0816 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 
179 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  59.78 
 
 
180 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  54.02 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  49.1 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  48.19 
 
 
176 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  48.48 
 
 
176 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  54.22 
 
 
180 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  48.21 
 
 
179 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  46.39 
 
 
220 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  52.1 
 
 
177 aa  161  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  50.92 
 
 
173 aa  160  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  46.15 
 
 
189 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  45.78 
 
 
196 aa  157  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  48.82 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  44.77 
 
 
197 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  43.86 
 
 
192 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  40.96 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  41.32 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  39.39 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  26.9 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  22.49 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  21.3 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  22.78 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  21.3 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  21.3 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  30.19 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.39 
 
 
193 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  30.19 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  27.54 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2904  2'-5' RNA ligase  28.85 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2653  hypothetical protein  28.85 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2951  2'-5' RNA ligase  28.85 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.3 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  26.53 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>