32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0604 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  67.46 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  67.46 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  42.6 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  42.6 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  42.6 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  41.42 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  42.01 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  42.6 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  42.01 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  40.83 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  42.01 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  42.01 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  41.42 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  40.83 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  40.24 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  27.94 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  27.84 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  23.98 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  25.83 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  26.97 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  22.78 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  24.58 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  27.62 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  24.57 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  18.34 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  22.76 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  20.12 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  24 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  19.19 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  24.02 
 
 		 185 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1793  Phosphoesterase HXTX  23.31 
 
 		 300 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.185656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>