52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2956 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 
189 aa  377  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  54.12 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  56.4 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  50.58 
 
 
176 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  50 
 
 
180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  52.6 
 
 
180 aa  165  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  46.15 
 
 
179 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  50.3 
 
 
196 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  51.76 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  50.31 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  49.69 
 
 
220 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  51.18 
 
 
197 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  47.27 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  43.9 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  43.72 
 
 
191 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  45.06 
 
 
187 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  43.2 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  48.48 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  47.27 
 
 
173 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  30.14 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  28.77 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  28.26 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  25.9 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  33.76 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  32.54 
 
 
184 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  27.73 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  27.01 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  29.05 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  20.12 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  29.05 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  24.71 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2904  2'-5' RNA ligase  28.71 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106965 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  24.71 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  25.52 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2653  hypothetical protein  28.71 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  25.96 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2951  2'-5' RNA ligase  28.71 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50571  predicted protein  27.89 
 
 
346 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
378 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>