45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1148 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  61.58 
 
 		 241 aa  245  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  37.71 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  37.71 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  37.57 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  33.53 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  34.3 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  35.39 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  33.14 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  25.79 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  28.18 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  26.52 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  31.01 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  31.01 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  30.38 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  30.38 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  28.66 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  30.38 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  28.49 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  28.85 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  28.26 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  29.75 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  29.75 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  33.76 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  29.51 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  30.38 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  31.29 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  31.29 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  28.99 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  30.11 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  29.45 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  28.31 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  27.6 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  28.99 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  28.39 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6208  2'-5' RNA ligase-like protein  21.74 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.697578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  39.66 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  27.95 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  26.35 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  24.43 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>