13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5279 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6208  2'-5' RNA ligase-like protein  27.12 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.697578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.49 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  29.55 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  26.42 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4276  2',5' RNA ligase  22.28 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.89353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  27.01 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  25.17 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0133  2',5' RNA ligase  26.92 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25834  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  25.97 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  24.32 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  29.37 
 
 		 179 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4484  2',5' RNA ligase  20.74 
 
 		 189 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>