49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0391 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  63.16 
 
 
207 aa  213  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  59.41 
 
 
176 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  58.18 
 
 
220 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  56.97 
 
 
182 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  51.19 
 
 
180 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  52.12 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  51.18 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  50.58 
 
 
189 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  48.48 
 
 
179 aa  166  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  51.19 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  48.47 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  49.37 
 
 
197 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  49.4 
 
 
192 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  51.19 
 
 
191 aa  156  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  50.91 
 
 
180 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  52.38 
 
 
188 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  49.4 
 
 
177 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  47.31 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  28.08 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  27.92 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  32.34 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  26.47 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  28.18 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  30.11 
 
 
193 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5279  hypothetical protein  29.55 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  29.79 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  30.97 
 
 
169 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3495  hypothetical protein  27.06 
 
 
313 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.941713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  23.3 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  26.92 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  23.3 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  25.54 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  26.04 
 
 
185 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  24.02 
 
 
198 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  31 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  25.36 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  25.36 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>