42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7967 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  59.09 
 
 
207 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  53.41 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  50.29 
 
 
180 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  54.07 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  54.82 
 
 
176 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  52.12 
 
 
176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  50.3 
 
 
189 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  45.78 
 
 
179 aa  157  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  50.29 
 
 
180 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  51.55 
 
 
177 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  46.06 
 
 
179 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  48.5 
 
 
173 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  45.29 
 
 
197 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  43.72 
 
 
192 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  45.18 
 
 
191 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  38.69 
 
 
187 aa  134  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  37.72 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  43.53 
 
 
188 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  27.52 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  28.19 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  27.52 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  27.52 
 
 
172 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  23.98 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  24.55 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  25.83 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  27.45 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  27.12 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  26.49 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  24.12 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  24.12 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  27.78 
 
 
183 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  27.95 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>