39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5967 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  71.27 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  59.41 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  59.2 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  53.71 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  51.76 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  55.69 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  54.82 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  52.66 
 
 		 197 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  48.19 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  52.66 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  51.79 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  53.33 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  50.59 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  50.31 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  49.1 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  45.06 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  45.35 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  43.21 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  24.42 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  24.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  23.12 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  22.54 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  24.4 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.31 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  22.62 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  39.29 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  22.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  21.37 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  21.37 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1793  Phosphoesterase HXTX  34.19 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.185656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>