42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  57.14 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  58.9 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  50 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  52.1 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  50.6 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  51.55 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  54.04 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  49.4 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  53.16 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  47.06 
 
 		 197 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  47.27 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  47.06 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  48.5 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  45.35 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  45.24 
 
 		 220 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  46.88 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  41.67 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  39.18 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  25.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  25.29 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  23.84 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  25.88 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  23.26 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  23.53 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  27.07 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  29.35 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  19.19 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  29.68 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  29.38 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  30.85 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  25.87 
 
 		 198 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  20.35 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  20.35 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>