44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4406 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  52.38 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  50.58 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  49.1 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  49.14 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  50.85 
 
 		 192 aa  160  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  50.28 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  50.92 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  48.48 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  43.71 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  46.88 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  44.24 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  43.53 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  50 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  43.53 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  39.39 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  43.45 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  39.51 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  38.18 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  26.63 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  26.04 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  23.67 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  29.25 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  35.4 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  28.57 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  22.73 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  22.73 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  21.97 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  22.83 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  25.74 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  26.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1793  Phosphoesterase HXTX  34.4 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.185656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>