40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1011 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  51.19 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  45.81 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  50.59 
 
 		 176 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  48.59 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  48.82 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  48.52 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  47.43 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  43.72 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  45.18 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  47.67 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  47.85 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  48.21 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  44.83 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  44.25 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  45.56 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  41.94 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  41.45 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  43.45 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  28.26 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  27.57 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  26.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  27.03 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  23.97 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  26.35 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  23.74 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  27.52 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  25.36 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  25 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  25 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>