37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0742 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  89.06 
 
 
197 aa  337  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  52.66 
 
 
176 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  54.71 
 
 
173 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  53.01 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  48.21 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  48.5 
 
 
207 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  49.4 
 
 
176 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  53.05 
 
 
182 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  47.93 
 
 
220 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  51.76 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  51.46 
 
 
188 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  43.86 
 
 
179 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  42.62 
 
 
196 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  47.06 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  48.5 
 
 
180 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  44.83 
 
 
191 aa  134  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 
187 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  37.72 
 
 
197 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  28.47 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  29.51 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  27.14 
 
 
172 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  27.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  29.8 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  24.11 
 
 
173 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  22.73 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2637  hypothetical protein  27.66 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.051238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  29.37 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  21.47 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>