37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0798 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0742  phosphoesterase HXTX  93.18 
 
 		 192 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397281  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5967  phosphoesterase HXTX  52.66 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  53.61 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0897  Phosphoesterase HXTX  54.12 
 
 		 173 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  51.19 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25850  2'-5' RNA ligase  47.67 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.559458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  46.07 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0662  2',5' RNA ligase  47.46 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.080094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  50.57 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2956  Phosphoesterase HXTX  51.18 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000421427  hitchhiker  0.000365932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  44.77 
 
 		 179 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4406  Phosphoesterase HXTX  50.28 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  45.29 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07860  2'-5' RNA ligase  47.06 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0985  Phosphoesterase HXTX  47.31 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  44.25 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1123  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.807549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1197  Phosphoesterase HXTX  39.52 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000148218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  29.17 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  27.08 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  27.08 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  27.6 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  28.48 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  29.32 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  23.75 
 
 		 169 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  23.75 
 
 		 169 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>