16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0631 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  35 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  33.33 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  33.33 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  32.78 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  32.57 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  34.86 
 
 		 241 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  32 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  30.34 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2637  hypothetical protein  23.08 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.051238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6208  2'-5' RNA ligase-like protein  22.58 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.697578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  27.12 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  27.89 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0798  2',5' RNA ligase  28.12 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.723464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0816  Phosphoesterase HXTX  26.53 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>