37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4420 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  63.84 
 
 
185 aa  241  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  56.83 
 
 
186 aa  217  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  56.42 
 
 
185 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  53.3 
 
 
187 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  53.3 
 
 
187 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  50.87 
 
 
182 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  34.3 
 
 
193 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 
184 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  32.56 
 
 
241 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  31.64 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  30.9 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  26.26 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  26.26 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  27.84 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  25.31 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2637  hypothetical protein  23.35 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.051238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  24.16 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  24.16 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3556  2',5' RNA ligase  30.17 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  26.92 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4203  Phosphoesterase HXTX  26.57 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  26.22 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  27.78 
 
 
196 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 
191 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 
184 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  21.9 
 
 
189 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.78 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>