46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0887 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0887  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1262  Phosphoesterase HXTX  63.74 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1293  Phosphoesterase HXTX  63.74 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1598  2',5' RNA ligase  56.22 
 
 
186 aa  213  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4420  2',5' RNA ligase  56.42 
 
 
183 aa  208  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3666  phosphoesterase HXTX  54.29 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0616  Phosphoesterase HXTX  51.14 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1148  Phosphoesterase HXTX  37.57 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00123846  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0631  2'-5' RNA ligase  35 
 
 
184 aa  104  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7052  Phosphoesterase HXTX  33.7 
 
 
241 aa  97.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  26.4 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0799  hypothetical protein  25.99 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  26.44 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  26.44 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  26.44 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0391  2',5' RNA ligase  28.18 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  25.86 
 
 
172 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  25.29 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1032  hypothetical protein  25.14 
 
 
169 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.292168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1013  hypothetical protein  25.14 
 
 
169 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7967  Phosphoesterase HXTX  27.45 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2637  hypothetical protein  18.79 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.051238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 
191 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  28.24 
 
 
184 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  26.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1011  2',5' RNA ligase  26.38 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  26.06 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 
215 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0816  Phosphoesterase HXTX  27.14 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3968  Phosphoesterase HXTX  26.45 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.792268  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0604  hypothetical protein  24.02 
 
 
169 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.89 
 
 
181 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  26.39 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  28.39 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>