202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2018 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
406 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
441 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  50.34 
 
 
443 aa  346  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
439 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  52.55 
 
 
446 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
477 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
437 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  48.38 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
459 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  46.65 
 
 
885 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  46.65 
 
 
885 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  45.79 
 
 
884 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
468 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  60.19 
 
 
209 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  54.67 
 
 
225 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  55.83 
 
 
209 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  58.1 
 
 
216 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  56.46 
 
 
215 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  55 
 
 
235 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  56.74 
 
 
224 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  55.83 
 
 
215 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  54.5 
 
 
221 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  55.87 
 
 
220 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 
443 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  54.81 
 
 
213 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  54.81 
 
 
213 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
459 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.67 
 
 
227 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  55.24 
 
 
251 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.67 
 
 
227 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  50.48 
 
 
231 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  54.03 
 
 
224 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  50 
 
 
231 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  54.29 
 
 
225 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  46.48 
 
 
219 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  53.64 
 
 
224 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  54.81 
 
 
213 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  52.04 
 
 
240 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  53.81 
 
 
225 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  53.81 
 
 
225 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  53.81 
 
 
215 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  53.81 
 
 
225 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  47.2 
 
 
219 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  37.94 
 
 
430 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  50 
 
 
222 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  56.04 
 
 
219 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  53.37 
 
 
215 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  47.62 
 
 
223 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  51.9 
 
 
216 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  52.13 
 
 
217 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  49.06 
 
 
215 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  55.29 
 
 
229 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  52.82 
 
 
220 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  53.05 
 
 
214 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  50.48 
 
 
210 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  55.17 
 
 
226 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  57.65 
 
 
223 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  53.05 
 
 
217 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
217 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  41.78 
 
 
239 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
210 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
210 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  42.25 
 
 
222 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
242 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  34.12 
 
 
217 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
223 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.76 
 
 
232 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
219 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
208 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
209 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  37.86 
 
 
669 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
220 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
222 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  37.98 
 
 
681 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  38.42 
 
 
679 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  38.42 
 
 
679 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  39.81 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  38.42 
 
 
845 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  34.12 
 
 
218 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  34.12 
 
 
218 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
229 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
232 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  38.83 
 
 
220 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  40.28 
 
 
668 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
210 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
232 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  36.41 
 
 
214 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
214 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  40.39 
 
 
217 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
230 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
208 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  36.23 
 
 
681 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
229 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
215 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
215 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  37.32 
 
 
235 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.32 
 
 
235 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5577  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.32 
 
 
235 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>