185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1335 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
446 aa  843    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  60.92 
 
 
441 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  59.45 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 
439 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  59.63 
 
 
477 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
441 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  59.49 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  58.63 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  53.26 
 
 
884 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  50.56 
 
 
885 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  50.56 
 
 
885 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
468 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
443 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  41.78 
 
 
430 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  66.67 
 
 
209 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  54.72 
 
 
231 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  55.13 
 
 
235 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  54.25 
 
 
231 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  55.22 
 
 
225 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  54.93 
 
 
222 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  58.46 
 
 
213 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  58.46 
 
 
213 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  60 
 
 
215 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  58.97 
 
 
209 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  58.21 
 
 
216 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  58.16 
 
 
215 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  57.07 
 
 
221 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  61 
 
 
225 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  58.96 
 
 
225 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
208 aa  193  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  58.49 
 
 
225 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  58.49 
 
 
225 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  56.52 
 
 
240 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  58.29 
 
 
224 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
210 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  58.59 
 
 
220 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  60.3 
 
 
251 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  49.75 
 
 
219 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  56.67 
 
 
215 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  52.66 
 
 
235 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  52.66 
 
 
235 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  52.66 
 
 
235 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  53.37 
 
 
216 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
210 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.72 
 
 
232 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  52.89 
 
 
227 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  51.13 
 
 
223 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  52.89 
 
 
227 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  45.63 
 
 
216 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  57.55 
 
 
220 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  57.84 
 
 
213 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  50.25 
 
 
223 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  53.81 
 
 
215 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  51.23 
 
 
219 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  45.63 
 
 
216 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  57.35 
 
 
215 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  58.88 
 
 
219 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
220 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  43.96 
 
 
218 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  43.96 
 
 
218 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  55.5 
 
 
229 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
214 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 
217 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  50.47 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  55.78 
 
 
210 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
230 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
219 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  50.48 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  48.8 
 
 
228 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  49.52 
 
 
679 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  49.52 
 
 
679 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.73 
 
 
230 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  49.52 
 
 
845 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  57.49 
 
 
214 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  59.54 
 
 
226 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
229 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
220 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
235 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  47.6 
 
 
224 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  47.34 
 
 
682 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  51.17 
 
 
223 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
224 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  52.53 
 
 
224 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  56.04 
 
 
223 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  51.63 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
232 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
222 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  53.77 
 
 
217 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  56.86 
 
 
217 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
242 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
220 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  48.57 
 
 
221 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  43.32 
 
 
229 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
223 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>