84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7040 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  64.76 
 
 
225 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  64.76 
 
 
225 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  64.76 
 
 
225 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  64.76 
 
 
225 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  54.93 
 
 
225 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  55.24 
 
 
210 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  53.7 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  55.77 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  54.42 
 
 
251 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.13 
 
 
227 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.13 
 
 
227 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  58.29 
 
 
477 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  53.7 
 
 
231 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  53.24 
 
 
231 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  48.08 
 
 
219 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  55.92 
 
 
441 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  55.19 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  57.82 
 
 
217 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  53.11 
 
 
215 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  49.52 
 
 
223 aa  184  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  56.81 
 
 
459 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  56.19 
 
 
219 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 
459 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  54.98 
 
 
224 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  55.24 
 
 
215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  48.08 
 
 
219 aa  181  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  57.43 
 
 
209 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  52.07 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  58.91 
 
 
437 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  52.58 
 
 
443 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  54.37 
 
 
213 aa  177  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  54.37 
 
 
213 aa  177  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  55.76 
 
 
214 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  51.43 
 
 
220 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  52.34 
 
 
224 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  53.62 
 
 
884 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  50.69 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  52.45 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
468 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 
439 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  54.5 
 
 
213 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  52.15 
 
 
215 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  52.15 
 
 
215 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  55.84 
 
 
240 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  54.88 
 
 
229 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  53.08 
 
 
406 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  52.36 
 
 
885 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  52.36 
 
 
885 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  54.86 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 
446 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  51.18 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
441 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  52.15 
 
 
216 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  50.94 
 
 
220 aa  157  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  45.02 
 
 
239 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  53.3 
 
 
223 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
443 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  38.92 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  29.78 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.96 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  29.31 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  33.06 
 
 
259 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  36.27 
 
 
314 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  32.67 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
528 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  31.97 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.18 
 
 
319 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  37.14 
 
 
407 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  31.85 
 
 
498 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  32 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  30.16 
 
 
408 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  25.1 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  27.74 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  29.84 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  34.67 
 
 
405 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.13 
 
 
405 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.67 
 
 
298 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.7 
 
 
313 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  24.64 
 
 
292 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  34.25 
 
 
409 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  28.21 
 
 
244 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>