74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0964 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  100 
 
 
209 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  64.73 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  64.73 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  60.29 
 
 
225 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  62.68 
 
 
225 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  59.9 
 
 
215 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  61.72 
 
 
225 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  61.72 
 
 
225 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  61.72 
 
 
225 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  58.49 
 
 
231 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  58.02 
 
 
231 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  61.46 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
477 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  55.98 
 
 
220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  59.02 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  56.86 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  58.22 
 
 
459 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  60 
 
 
216 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  58.45 
 
 
443 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  56.81 
 
 
227 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  56.81 
 
 
227 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  54.5 
 
 
222 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  57.21 
 
 
441 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  58.91 
 
 
240 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  60.41 
 
 
437 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  56.4 
 
 
224 aa  204  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 
459 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  56.34 
 
 
235 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  54.5 
 
 
216 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  56.25 
 
 
217 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 
406 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  58.17 
 
 
210 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
446 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  53.33 
 
 
221 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  58.59 
 
 
885 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  58.59 
 
 
885 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  57.42 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  61.54 
 
 
441 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  49.76 
 
 
219 aa  194  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  54.76 
 
 
220 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  55.02 
 
 
224 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  58.38 
 
 
439 aa  191  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  56.4 
 
 
229 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  54.68 
 
 
884 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  57 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  54.59 
 
 
224 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  50.71 
 
 
219 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  50.71 
 
 
223 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  55.45 
 
 
215 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  54.19 
 
 
223 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  53.59 
 
 
215 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  54.03 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  55.72 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  54.03 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
468 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  55.43 
 
 
226 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  42.99 
 
 
239 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
443 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  35.12 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  28.65 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  27.73 
 
 
295 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 
295 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  24.29 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.67 
 
 
292 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  26.42 
 
 
298 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  25.36 
 
 
266 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  30.18 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  37.25 
 
 
419 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  27.06 
 
 
295 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.8 
 
 
261 aa  42  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  27.23 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>