63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4552 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  61.54 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  56.28 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  59.13 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  56.8 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  55.87 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  55.56 
 
 		 441 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  58.71 
 
 		 437 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  55.02 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  55.02 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  54.13 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  55.05 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  50.45 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  54.72 
 
 		 459 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  50 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  49.54 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  54.71 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 406 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  54.63 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 		 459 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  52.61 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  51.64 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  55.61 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 477 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  59.28 
 
 		 885 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  59.28 
 
 		 885 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 446 aa  181  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  55.45 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  52.07 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  54.37 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  57.79 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  47.64 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  54.38 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  50.24 
 
 		 443 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  53.39 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  56.35 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  47.89 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  47.64 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 		 468 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  53.46 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  50.95 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  53 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  53 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  55.56 
 
 		 884 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  49.52 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  53.71 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  50.46 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  50.98 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  51.18 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 441 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  52.31 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  54.5 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  51.18 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  46.45 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  40.93 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  35.35 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  27 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 443 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>