67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0959 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  60.7 
 
 
443 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  60.68 
 
 
441 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  55.98 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  62.31 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  56.87 
 
 
222 aa  207  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  57.07 
 
 
215 aa  202  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  56.42 
 
 
225 aa  201  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  57.07 
 
 
231 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  56.68 
 
 
225 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  56.68 
 
 
225 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  56.68 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  56.57 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  59.6 
 
 
439 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  58.38 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  55.17 
 
 
213 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  55.17 
 
 
213 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  55.5 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  57.08 
 
 
223 aa  194  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  59.8 
 
 
885 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  59.8 
 
 
885 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  58.59 
 
 
446 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  54.93 
 
 
215 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
437 aa  191  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  56.28 
 
 
216 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 
477 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
459 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
441 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  57.49 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  54.46 
 
 
884 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  51.43 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  54.11 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 
459 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  52.33 
 
 
215 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  53.5 
 
 
235 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  51.42 
 
 
220 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  45.5 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  53.77 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
406 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  46.92 
 
 
219 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  54.92 
 
 
251 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  52.22 
 
 
214 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  45.21 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  52.88 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  52.24 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  54.6 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  51.24 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
468 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  45 
 
 
239 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  52.17 
 
 
217 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  50.25 
 
 
210 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  46.45 
 
 
227 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  46.45 
 
 
227 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  49.25 
 
 
221 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  50 
 
 
213 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  48.48 
 
 
224 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  45.85 
 
 
224 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
443 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  39.58 
 
 
430 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  30.32 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  30.32 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  30.32 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  30.33 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  37.29 
 
 
425 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 
328 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>