40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1968 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  30.58 
 
 		 884 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  32.48 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  28.32 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  29.44 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  26.7 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  31.06 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  30.73 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  27.5 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  27.5 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  27.75 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  29.68 
 
 		 443 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 477 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  26.49 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  27 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  27.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  28.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  30.52 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 459 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  27.8 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  29.61 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  26.54 
 
 		 441 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 446 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  29.76 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  29.47 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  29.76 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 459 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  30.95 
 
 		 885 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  30.95 
 
 		 885 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  27 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  27 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  27.6 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  25.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  31.97 
 
 		 430 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  27.39 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>