182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2392 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
459 aa  924    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  72.07 
 
 
235 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  67.76 
 
 
682 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  56.6 
 
 
225 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  50.24 
 
 
217 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  51.8 
 
 
229 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  59.05 
 
 
222 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  59.41 
 
 
213 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  59.41 
 
 
213 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
224 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  55.87 
 
 
668 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
223 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  58.22 
 
 
209 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  55.94 
 
 
231 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  58.57 
 
 
215 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  55.45 
 
 
231 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  60.77 
 
 
885 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  60.77 
 
 
885 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  55.14 
 
 
225 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  56.81 
 
 
219 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  46.85 
 
 
232 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  52.47 
 
 
669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  55.19 
 
 
225 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  55.19 
 
 
225 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  55.19 
 
 
225 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  53.17 
 
 
681 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  48.37 
 
 
235 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.37 
 
 
235 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
219 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  55.66 
 
 
240 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.37 
 
 
235 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  48.62 
 
 
228 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  51.74 
 
 
679 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  51.74 
 
 
679 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  51.46 
 
 
681 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
220 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  46.38 
 
 
216 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  51.74 
 
 
845 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 
214 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  46.38 
 
 
216 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  56.67 
 
 
216 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  57.47 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  58.08 
 
 
215 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.72 
 
 
227 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
227 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.72 
 
 
227 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  57.5 
 
 
213 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
227 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
227 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  54.03 
 
 
221 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
229 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  51.79 
 
 
418 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  55.88 
 
 
224 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
406 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  56.72 
 
 
209 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  49.52 
 
 
219 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  52.4 
 
 
221 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  57.92 
 
 
215 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  56.57 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  50.73 
 
 
352 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  54.72 
 
 
220 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  56.16 
 
 
441 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  55 
 
 
884 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  53.88 
 
 
216 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
225 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  49.76 
 
 
681 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  49.76 
 
 
230 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
446 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  54.46 
 
 
214 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
235 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
220 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
241 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  55.07 
 
 
217 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  59.5 
 
 
229 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
210 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
437 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  45.32 
 
 
210 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  58.05 
 
 
226 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  49.52 
 
 
219 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  52.58 
 
 
215 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
220 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  46.7 
 
 
224 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  52.38 
 
 
210 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  47.91 
 
 
223 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  53.3 
 
 
220 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  51.63 
 
 
215 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
230 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  53.08 
 
 
224 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  44.29 
 
 
218 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  44.29 
 
 
218 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
223 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
232 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  54.5 
 
 
251 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  50.45 
 
 
223 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
439 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  52.68 
 
 
224 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>