64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_670 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  94.01 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  95.87 
 
 		 219 aa  407  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  50.93 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  50.47 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 437 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  52.63 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  49.77 
 
 		 441 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  50 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  49.77 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  49.07 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  49.3 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  49.3 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  49.3 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  50 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  55.49 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  50.49 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  47.6 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  51.79 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  52.79 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  51.42 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  48.82 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  47.22 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 477 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  50.23 
 
 		 443 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 		 439 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  51.02 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  54 
 
 		 459 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  50.24 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  50.71 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  47.87 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  48.34 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  50.5 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  50.75 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 		 446 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  51.4 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  47.91 
 
 		 459 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  48.77 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  46.95 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  46.95 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  46.26 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  50.7 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  49.53 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  49.53 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  51.78 
 
 		 885 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  51.78 
 
 		 885 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 		 468 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  50.48 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 406 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  49.04 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  48.51 
 
 		 884 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  48.33 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  41.26 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  49.53 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  45.21 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  48.58 
 
 		 441 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  45.21 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 443 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  31.86 
 
 		 430 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  26.49 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.02 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02861  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.08 
 
 		 371 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>