67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0482 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  100 
 
 
220 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  58.77 
 
 
225 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  58.02 
 
 
231 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  57.55 
 
 
231 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  59.52 
 
 
222 aa  224  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  63.38 
 
 
251 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  60.28 
 
 
229 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  57.99 
 
 
235 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  60.19 
 
 
215 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  60.98 
 
 
240 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  59.07 
 
 
215 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  61.4 
 
 
214 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  60.93 
 
 
441 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  59.53 
 
 
437 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  58.88 
 
 
443 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  56.87 
 
 
213 aa  204  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  56.87 
 
 
213 aa  204  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  58.41 
 
 
224 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  55.19 
 
 
216 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  57.62 
 
 
209 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  48.6 
 
 
239 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  58.06 
 
 
216 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  59.15 
 
 
406 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  58.37 
 
 
213 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  57.55 
 
 
459 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  56.94 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  58.1 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  58.8 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  56.6 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
468 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  60.85 
 
 
446 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  60.48 
 
 
439 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  53.64 
 
 
224 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  57.27 
 
 
225 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
441 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  57.27 
 
 
225 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.38 
 
 
227 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  57.27 
 
 
225 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.38 
 
 
227 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
477 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  48.58 
 
 
219 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  60 
 
 
226 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  54.63 
 
 
220 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  54.55 
 
 
224 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  56.73 
 
 
219 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  55.66 
 
 
210 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  49.53 
 
 
219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  53.77 
 
 
215 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  58.88 
 
 
885 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  58.88 
 
 
885 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  49.53 
 
 
223 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
459 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  52.83 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  52.25 
 
 
884 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  51.4 
 
 
223 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  54.55 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  38.76 
 
 
430 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  40.27 
 
 
443 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.34 
 
 
295 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 
356 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  33.78 
 
 
295 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  33.57 
 
 
215 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
365 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>