66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3232 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  57.08 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  55.19 
 
 
441 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 
437 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  58.74 
 
 
209 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  54.19 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  53.92 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  57.65 
 
 
884 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  56.78 
 
 
443 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  55.39 
 
 
213 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  55.39 
 
 
213 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  57.95 
 
 
477 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
439 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  56.93 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  51.82 
 
 
459 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  56.93 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  56.93 
 
 
225 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  58.29 
 
 
885 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  58.29 
 
 
885 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  54.21 
 
 
225 aa  187  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  57.95 
 
 
215 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 
446 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  57.14 
 
 
216 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  54.04 
 
 
235 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.63 
 
 
227 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.63 
 
 
227 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  52.61 
 
 
231 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  52.83 
 
 
225 aa  184  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  52.13 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 
406 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  52.56 
 
 
222 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  58.67 
 
 
459 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  52.73 
 
 
224 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  53.3 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
468 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  52.13 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  57.42 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
441 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  51.63 
 
 
215 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 
217 aa  167  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  53.09 
 
 
219 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  49.05 
 
 
215 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  48.79 
 
 
216 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  51.64 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  53 
 
 
213 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  56.12 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  53.37 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  44.44 
 
 
219 aa  162  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  43.06 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  51.52 
 
 
224 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  50.51 
 
 
224 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  50.77 
 
 
221 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  45.21 
 
 
223 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  50.78 
 
 
210 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  51.66 
 
 
217 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  52.04 
 
 
214 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  50.57 
 
 
226 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  43.13 
 
 
239 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  36.46 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  26.73 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  23.58 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  28 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 
207 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>