135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1413 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
222 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
208 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
223 aa  157  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
221 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
459 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  41.59 
 
 
214 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  43.96 
 
 
682 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  46.12 
 
 
214 aa  151  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  41.59 
 
 
216 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 
216 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
230 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  38.28 
 
 
217 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
223 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
207 aa  148  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  47.64 
 
 
220 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
226 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
229 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  41.67 
 
 
443 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
225 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
225 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  43.63 
 
 
210 aa  144  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  38.39 
 
 
216 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  43.13 
 
 
224 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
441 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
208 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  38.39 
 
 
216 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
209 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
477 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  43.48 
 
 
885 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  43.48 
 
 
885 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
208 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
221 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
220 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  43.06 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  45.41 
 
 
669 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2301  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
215 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
229 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  43.6 
 
 
441 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  44.65 
 
 
418 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  44.28 
 
 
439 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
207 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
215 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
215 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
443 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
459 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
217 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  42.79 
 
 
681 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  37.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  37.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  43.06 
 
 
884 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
208 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  46.86 
 
 
668 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  44.76 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  43.54 
 
 
352 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  42.31 
 
 
845 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  42.31 
 
 
679 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  42.31 
 
 
679 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.31 
 
 
681 aa  128  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 
209 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
234 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.9 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  39.63 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  43.32 
 
 
232 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
227 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
227 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
227 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 
226 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
437 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  45.62 
 
 
224 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 
222 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  43.32 
 
 
238 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  39.9 
 
 
681 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
232 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
468 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 
222 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0412  phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>