141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0965 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  45.15 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  46.83 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  46.83 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  46.83 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  47.34 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  47.34 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.09 
 
 
232 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
214 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
223 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
219 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  45.85 
 
 
216 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
230 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
224 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  45.37 
 
 
216 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
241 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
235 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
220 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  49.04 
 
 
220 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
242 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  48.54 
 
 
679 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  48.54 
 
 
679 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  48.54 
 
 
845 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  46.12 
 
 
682 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
225 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
229 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
221 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
222 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  47.34 
 
 
418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  45.41 
 
 
221 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
220 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
232 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.06 
 
 
230 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
208 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
220 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
229 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
211 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
441 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
226 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  48.06 
 
 
681 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  46.89 
 
 
884 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  46.19 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
477 aa  171  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  41.95 
 
 
224 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  47.57 
 
 
443 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
223 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  45.93 
 
 
352 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
209 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  46.12 
 
 
681 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
210 aa  168  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  48.54 
 
 
668 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
210 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
238 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
437 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  43.69 
 
 
228 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  45.63 
 
 
669 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  44.98 
 
 
885 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  44.98 
 
 
885 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
223 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
446 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
459 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  44.93 
 
 
681 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  45.97 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
232 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
223 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  47.32 
 
 
220 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  42.03 
 
 
441 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
215 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
439 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
245 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
459 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
208 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
208 aa  154  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
222 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  47.44 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  43.78 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.48 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2301  phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
215 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
217 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  39.61 
 
 
223 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
232 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
214 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
207 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
234 aa  148  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>