161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2045 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  57.48 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  55.3 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  51.2 
 
 		 885 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  51.2 
 
 		 885 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  49.08 
 
 		 884 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.49 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 441 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  51.91 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  46.38 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 214 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  47.87 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.87 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.87 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  41.78 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  41.78 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  41.04 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  46.73 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  45.05 
 
 		 682 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  42.86 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  44.71 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  40.47 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  40.95 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  46.89 
 
 		 441 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 443 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 437 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 477 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  45.93 
 
 		 443 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  46.81 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  44.61 
 
 		 679 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  44.61 
 
 		 679 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  42.92 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  45.58 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  44.61 
 
 		 845 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  44.95 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  41.63 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  46.79 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 		 459 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  42.23 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  44.44 
 
 		 352 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.27 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 		 459 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  42.36 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  41.2 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 		 468 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  39.91 
 
 		 430 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.58 
 
 		 681 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 446 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.27 
 
 		 681 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  42.06 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 		 439 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  45.24 
 
 		 669 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  48.15 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  45.02 
 
 		 668 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>