135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00882 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
221 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
223 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  48.4 
 
 
242 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
222 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
235 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  53.49 
 
 
220 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  49.32 
 
 
682 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  50.68 
 
 
235 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.68 
 
 
235 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.68 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  50.46 
 
 
884 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  48.85 
 
 
214 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
208 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  44.39 
 
 
216 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  44.95 
 
 
218 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
214 aa  168  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
208 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  49.3 
 
 
226 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
221 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  44.95 
 
 
218 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  49.08 
 
 
232 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  43.93 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  51.87 
 
 
885 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  51.87 
 
 
885 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  47.44 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  48.18 
 
 
229 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
230 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  39.55 
 
 
217 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
223 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
229 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
459 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  46.33 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
241 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  46.3 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  48.13 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
207 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
220 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
210 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
220 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  47.66 
 
 
669 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  39.07 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  48.64 
 
 
443 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
202 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  47.69 
 
 
221 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
207 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  47.49 
 
 
211 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
441 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  48 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  45.33 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  49.3 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  46.79 
 
 
443 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  46.4 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
226 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  47.83 
 
 
260 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
210 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  46.22 
 
 
668 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  44.84 
 
 
232 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 
477 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  47.96 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
223 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
209 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
459 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  38.74 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
234 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  46.36 
 
 
214 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  43.58 
 
 
352 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  44.65 
 
 
681 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2301  phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  44.19 
 
 
679 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.26 
 
 
681 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  44.19 
 
 
679 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  46.73 
 
 
418 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  44.19 
 
 
845 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  45.62 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  41.59 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
217 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>