136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3103 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  55.71 
 
 
214 aa  228  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  57.45 
 
 
226 aa  224  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  54.5 
 
 
216 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 
216 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  53.2 
 
 
208 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  45.07 
 
 
222 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
223 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
214 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
217 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
242 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  40.1 
 
 
223 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  42.86 
 
 
885 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  42.86 
 
 
885 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
443 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
208 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  42.08 
 
 
679 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  42.08 
 
 
679 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  42.08 
 
 
845 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
223 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
226 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 
241 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
209 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
221 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
232 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  43.12 
 
 
681 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  39.62 
 
 
352 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  41.75 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
221 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  38.68 
 
 
682 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
219 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
232 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
459 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  41.26 
 
 
669 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  38.71 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.71 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  42.42 
 
 
260 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.71 
 
 
235 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
208 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  38.35 
 
 
218 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 
477 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  38.35 
 
 
218 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  41.95 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  38.6 
 
 
884 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
211 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.39 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  40 
 
 
681 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  33.82 
 
 
217 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  38.64 
 
 
441 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  34.45 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  40 
 
 
681 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  39.81 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  34.45 
 
 
216 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
208 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
223 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.14 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  37.05 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
238 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.45 
 
 
216 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  40.28 
 
 
668 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
224 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  38.24 
 
 
430 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  39.07 
 
 
418 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
229 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
209 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
222 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
207 aa  122  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
225 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
232 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
230 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
225 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
441 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 
223 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
225 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  38.21 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  36.07 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  42.11 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  33.98 
 
 
443 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
223 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  36.45 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>