135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0394 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  69.57 
 
 		 214 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  67.72 
 
 		 226 aa  270  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 		 208 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  58.79 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  52.68 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  44.17 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  44.6 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 242 aa  160  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  44.29 
 
 		 885 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  44.29 
 
 		 885 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  43 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  44.6 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  43.96 
 
 		 682 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  44.84 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  42.44 
 
 		 352 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.58 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  40.87 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 441 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  41.83 
 
 		 884 aa  147  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  41.35 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.35 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 214 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.35 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  41.23 
 
 		 443 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  40.29 
 
 		 679 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  40.29 
 
 		 679 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 439 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  40.29 
 
 		 845 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  40.95 
 
 		 681 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  41.71 
 
 		 681 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  40.67 
 
 		 418 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  36.84 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 477 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  40.38 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  39.62 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 459 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.78 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  36.84 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  36.84 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  39.15 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 		 437 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 443 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  39.61 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  40.29 
 
 		 669 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  41.83 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 459 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  40.1 
 
 		 681 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  41.36 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  38.16 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  36.06 
 
 		 441 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 		 446 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  41.59 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 238 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 468 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>