157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
234 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
242 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
443 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
208 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.57 
 
 
232 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
220 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  48.11 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  45.13 
 
 
430 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 
223 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
208 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  42.23 
 
 
214 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  46.6 
 
 
682 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  39.61 
 
 
216 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  40.58 
 
 
216 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  46.86 
 
 
681 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  48.33 
 
 
441 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
223 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  46.26 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  38.46 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
209 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
214 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
220 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
437 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
235 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  42.01 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  43.84 
 
 
679 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  43.84 
 
 
679 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
224 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  43.84 
 
 
845 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
223 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
222 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  45.93 
 
 
681 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 
220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  40.83 
 
 
224 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  46.15 
 
 
681 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
221 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
222 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  45.63 
 
 
221 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
459 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
468 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
245 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  46.83 
 
 
220 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  44.66 
 
 
220 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
232 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
218 aa  141  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
439 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  45.19 
 
 
216 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  42.03 
 
 
885 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  42.03 
 
 
885 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
210 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  43.72 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
225 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.23 
 
 
230 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
441 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
208 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
229 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  36.41 
 
 
218 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  36.41 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  43.81 
 
 
352 aa  134  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  39.45 
 
 
216 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  39.45 
 
 
216 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  40.38 
 
 
884 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  40.38 
 
 
443 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  42.18 
 
 
669 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2301  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
215 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 
477 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  37.91 
 
 
214 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>